EVALUASI TURUNAN PHLOROTANNIN DALAM MAKROALGA COKELAT (Sargassum sp.) UNTUK POTENSI MODULASI HUMAN PPAR-GAMMA SEBAGAI INHIBITOR ANTI-DIABETES: KAJIAN PENAMBATAN MOLEKUL

Lilis Silviana, Muhamad Ilham Bintang, Ivan Andriansyah, Deden Indra Dinata, Aiyi Asnawi

Abstract


Diabetes Mellitus merupakan masalah kesehatan global dengan jumlah kasus yang terus meningkat, khususnya Diabetes Mellitus Tipe 2. Salah satu intervensi pengobatannya melalui penghambatan PPAR (Peroxisome proliferator-activated receptor). Di sisi lain, penggunaan akarbosa jangka panjang dapat menyebabkan gangguan pencernaan, hati, dan ginjal. Makroalga cokelat, khususnya Sargassum sp., mengandung senyawa bioaktif florotanin yang berpotensi memberikan manfaat kesehatan, namun turunannya belum dilaporkan. Tujuan penelitian ini untuk menyelidiki potensi afinitas dan interaksi pengikatan senyawa turunan florotann dari makroalga cokelat dengan reseptor Human PPAR-Gamma melalui simulasi penambatan molekul. Prosedur penambatan molekul divalidasi secara cermat dengan melakukan penambatan molekul ulang ligan alami ((2S)-2-Etoksi-3-[4-(2-{4-[(Methylsulfonyl) oxy]Phenyl}Ethoxy)Phenyl]Propanoic Acid) ke dalam enzim situs aktif, menghasilkan nilai Root Mean Square Deviation (RMSD) rendah di bawah 2 Å. Langkah validasi ini memastikan keandalan algoritma penambatan molekul yang dipilih, AutoDock 4.2.6, dan parameternya untuk evaluasi penambatan ligan uji. Simulasi penambatan molekul selanjutnya dilakukan untuk sembilan ligan phlorotannin, mengungkapkan beragam afinitas pengikatan dan profil interaksi. Khususnya, senyawa seperti Dieckol, 7-phloroeckol, Phlorofucofuroeckol A, dan Eckol menunjukkan energi pengikatan yang kuat dan interaksi yang menjanjikan dengan residu utama, yang menunjukkan potensinya sebagai ligan efektif untuk enzim Human PPAR-Gamma. Analisis rinci ikatan hidrogen dan interaksi hidrofobik memberikan gambaran tentang mekanisme molekuler ligan dalam situs pengikatan enzim terutama residu B:Ser 289 dan B:His449, diidentifikasi sebagai kontributor penting dalam interaksi ligan-enzim. Dapat disimpulkan, Dieckol merupakan kandidat senyawa pemandu dari penambatan senyawa turunan florotanin dari makroalga cokelat dan Human PPAR-Gamma.


Keywords


autodock; marine; medicine

Full Text:

PDF

References


CDC. Centers for Disease Control and Prevention. (2022). What is Diabetes? Diakses pada 28 Maret 2023, dari https://www.cdc.gov/diabetes/basics/diabetes.html

American Diabetes Association. Diagnosis and Classification of Diabetes Mellitus. Diabetes Care. 2013 Dec 16;37(Supplement_1):S81–90.

Riwu M, Subarnas A, Lestari K. Korelasi faktor usia, cara minum, dan dosis obat metformin terhadap risiko efek samping pada penderita diabetes melitus tipe 2. J Farm Klin Indones. 2015;4(3):151–61.

Ischak NI, Aman LO, Hasan H, Kilo AL, Asnawi A. In silico screening of Andrographis paniculata secondary metabolites as anti-diabetes mellitus through PDE9 inhibition. Res Pharm Sci. 2023 Feb;18(1):100.

Nur S, Febrina E, Asnawi A, Syafiie S. Synthesis and Inhibitory Activity of Curculigoside A Derivatives as Potential Anti-Diabetic Agents with β-Cell Apoptosis. Journal of Molecular Structure. 2022;1265:1-8.

Rusdi MS. Hipoglikemia Pada Pasien Diabetes Melitus. J Syifa Sci Clin Res. 2020;2(2):83–90.

Nursamsiar N, Mangande MM, Awaluddin A, Nur S, Asnawi A. (2020). In Silico Study of Aglycon Curculigoside A and Its Derivatives as α-Amilase Inhibitors. Indonesian Journal of Pharmaceutical Science and Technology. 2020;7(1):29-37.

Janani C, Kumari BR. PPAR gamma gene–a review. Diabetes Metab Syndr Clin Res Rev. 2015;9(1):46–50.

Pawestri S, Wijayanti R, Kurnianto D. Kajian Pustaka: Potensi Kandungan Polifenol pada Sargassum sp. sebagai Alternatif Penanganan Diabetes Mellitus Tipe 2 Literature Review: Polyphenols of Sargassum sp. Potential as Alternative Treatment for Type 2 Diabetes Mellitus. J Ilmu Pangan Dan Has Pertan. 2021;5(2):118–39.

Li Y, Ks N, Byran G, Krishnamurthy PT. Identification of Selective PPAR-γ Modulators by Combining Pharmacophore Modeling, Molecular Docking, and Adipogenesis Assay. Appl Biochem Biotechnol. 2023;195(2):1014–41.

Kim S, Chen J, Cheng T, Gindulyte A, He J, He S, et al. PubChem 2019 update: improved access to chemical data. Nucleic Acids Res. 2019;47(D1):D1102–9.

Cronet P, Petersen JF, Folmer R, Blomberg N, Sjöblom K, Karlsson U, et al. Structure of the PPARα and-γ ligand binding domain in complex with AZ 242; ligand selectivity and agonist activation in the PPAR family. Structure. 2001;9(8):699-706.

Jejurikar BL, Rohane SH. Drug designing in discovery studio. 2021;

Morris GM, Huey R, Lindstrom W, Sanner MF, Belew RK, Goodsell DS, et al. AutoDock4 and AutoDockTools4: Automated docking with selective receptor flexibility. J. Comput Chem. 2009;30(16):2785–91.

Asnawi A, Nedja M, Febrina E, Purwaniati P. Prediction of a Stable Complex of Compounds in the Ethanol Extract of Celery Leaves (Apium graveolens L.) Function as a VKORC1 Antagonist: http://.www.doi.org/10.26538/tjnpr/v7i2.10. Trop J Nat Prod Res TJNPR. 2023;7(2):2362–70.

Yusuf D, Davis AM, Kleywegt GJ, Schmitt S. An alternative method for the evaluation of docking performance: RSR vs RMSD. J Chem Inf Model. 2008;48(7):1411–22.

Meiyanto E. Docking kurkumin dan senyawa analognya pada reseptor progesteron: studi interaksinya sebagai selective progesterone receptor modulators (SPRMs). Pharmacon J Farm Indones UMS. 2012;13(2):55–60.

Asnawi A, Febrina E, Aligita W, Kurnia D, Aman LO, Yuliantini A. Screening of ashitaba (angelica keiskei K.) compounds as potential mycobacterium tuberculosis kasa inhibitors. Int J Appl Pharm. 2022;14:80–5.

Cahyaningrum K, Husni A, Budhiyanti SA. Aktivitas antioksidan ekstrak rumput laut cokelat (Sargassum polycystum). Agritech. 2016;36(2):137–44.

Shintia M. Kajian senyawa derivat florotanin ecklonia cava sebagai kandidat anti SARS-CoV-2 berdasarkan pendekatan molecular docking. S1 thesis, Universitas Pendidikan Indonesia. Diakses pada 28 Maret 2023, dari http://repository.upi.edu/51842/.

Variya BC, Modi SJ, Savjani JK, Patel SS. In silico molecular docking and pharmacokinetic prediction of gallic acid derivatives as PPAR- agonists. Int J Pharm Pharm Sci. 2017:9(1);102–7.




DOI: https://doi.org/10.52447/inrpj.v9i1.7335

Refbacks

  • There are currently no refbacks.


Copyright@ Pusat Penelitian Fakultas Farmasi

Universitas 17 Agustus 1945 Jakarta

Online ISSN : 2502-8421

 

Pengunjung